都是癌症,为什么有的人可以活几十年、有的人很快离世?33种癌症、超10000万名患者基因数据分析寻找答案

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都是癌症,为什么有的人可以活几十年、有的人很快离世?33种癌症、超10000万名患者基因数据分析寻找答案

随着全球人口老龄化的加剧,癌症新发病例数不断升高,癌症治疗面临着严峻的挑战。除了创新性疗法比如免疫治疗的发展之外,我们还需要了解患者自身癌症的严重程度,以进行定制化的治疗,避免过度治疗和治疗不足情况的出现。
过度治疗则可能为患者带来不必要的副作用;治疗不足则有可能给侵袭性癌症以时间,让他们发展到威胁生命的程度——那么不同的癌症患者,有什么样特征会活的更长久?又有哪些特征可能降低生存期呢?
近期一项发表在《Cell Report》杂志上的研究就为我们带来了最新的颠覆性发现,研究人员通过对多达33种癌症、10884名癌症患者的数据进行了分析,以寻找那些和癌症患者预后相关的指标

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文章标题:Genome-wide identification and analysis of prognostic features in human cancers,

图片来源:《Cell Reports》杂志官网

生物标志物(Biomarker)在医学上通常指那些可以反映出某种疾病是否出现或出现后严重程度的物质;癌症预后生物标志物的鉴定可以帮助临床医生评估哪些癌症患者最有可能出现癌症转移
2006年,一项大型的、多年期的肿瘤基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)计划由美国国家癌症研究所(National Cancer Institute,NCI)和美国国家人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute,NHGRI)联合启动,共计招募了33种不同癌症多达10884名癌症患者,并在此后对肿瘤患者的基因表达、突变、拷贝数改变、DNA甲基化、microRNA表达和蛋白质表达等基因组数据进行了分析,并收集了患者最终生存期数据
都是癌症,为什么有的人可以活几十年、有的人很快离世?33种癌症、超10000万名患者基因数据分析寻找答案本次研究纳入的33种癌症患者,不同分析指标下的患者数量及对应的最终生存联系

(图片来源:参考资料1)

在本次研究中,研究人员一共对近31万个变量进行了分析,最终找到了不同癌症和预后生存时间密切相关的典型生物标记物。

都是癌症,为什么有的人可以活几十年、有的人很快离世?33种癌症、超10000万名患者基因数据分析寻找答案不同癌症与预后时间相关的生物标记物

研究发现,尽管我们很难用单一的生物标志物其预测所有的癌症预后生存情况,但是在不同的癌症中有自己独特的一些生物标志物标签。比如我们最常说的TP53基因就和10种癌症的生存期降低有关。但是从总体结果上来看:和基因数据相比较来说,基因的拷贝数改变和癌症的预后有着更密切的联系
人类的细胞中有23对染色体,但是当罹患癌症的时候,细胞获得或者丢失染色体的时候,细胞的拷贝数就会发生改变,从而导致基因数量的增加或者减少。在数据分析中发现,基因突变带来的和癌症生存期相关的信息较少,但是基因拷贝数,则蕴含着大量的预后信息,这可能帮助我们了解哪些患者在患癌后可以获得比较好的生存预期。
另外,研究人员创建了一个门户网站,可以允许不同的人测试基因、癌症以及生存期的联系,点击阅读原文进入官网查询。
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该网站首页,图片来源:https://tcga-survival.com
相信随着人们对于癌症了解的不断深入,我们将有望找到更多的癌症相关生物标志物,从而制定更加精准化的癌症治疗方案。
作者:CellPlus    审校:小龙包    封面来源:创客贴

参考资料(向下滑动查看)

[1] Joan C. Smith et al, Genome-wide identification and analysis of prognostic features in human cancers, Cell Reports (2022). DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110569

[2] Learning which genetic changes predict greatest risk of cancer death.https://medicalxpress.com/news/2022-04-genetic-greatest-cancer-death.html

 

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