密切关注!科学家在新冠病毒研究中发现新的独特突变,与当年SARS的情况类似。是否意味着新冠病毒正在自行消弱、消亡?
最近这两天,围绕“前浪”、“后浪”、“一代不如一代”的话题刷屏,刷爆朋友圈、微信群。赶巧的是,新冠病毒(SARS-CoV-2)也面临同样的问题。近日,一篇研究新冠病毒基因突变的文章受到广泛的关注。
Efrem Lim博士(来源:ASU官网)
亚利桑那州立大学生物设计研究所助理教授Efrem Lim博士领导的团队致力于研究新冠病毒如何随时间传播、变异和适应。他们的最新研究结果在线发表在《病毒学杂志》(Journal of Virology)上,文章题目为“An 81 nucleotide deletion in SARS-CoV-2 ORF7a identified from sentinel surveillance in Arizona (Jan-Mar 2020)”。而文稿在预印平台本网站medRxiv上一经公布,就引起了包括世界卫生组织(WHO)在内的全球科学界的关注。
(图片来源:参考资料2)
作为一位病毒学家,Efrem Lim教授和他的团队使用病毒发现工具来研究人类健康和疾病中宿主-病毒的相互作用,他们的研究被用于精确医学,可将疾病预防和治疗个性化。为了追踪病毒的全球踪迹,Lim教授团队使用NGS(next-generation sequencing,下一代测序新技术)快速通读新冠病毒基因组的30,000个碱基(化学字母)。每个病毒序列都被存放在一个全球基因库中,该基因库由一个名为GISAID的非营利性科学组织运营。迄今为止,GISAID的EpiCoVTM数据库已经存储了超过16,000个SARS-CoV-2序列。对首批亚利桑那州新冠病例的序列数据分析显示,该州发现的病毒最有可能来自欧洲。
现在,利用从亚利桑那州疑似COVID-19患者那里获得的382个鼻拭子样本,Lim教授团队发现了从未被发现的SARS-CoV-2突变,其中81个碱基消失了,它们被从基因组中永久删除了。
Lim教授表示:该突变引起人们关注的原因之一是,它对应2003年SARS疫情爆发时发生的大幅度碱基删除。在SARS疫情的中期和后期,SARS病毒积累了使其传染性减弱的突变。科学家们认为,如果一种减弱病毒能够通过不知不觉中被感染的人在人群中有效地传播,则具有选择优势。
Lim教授和他的同事们对这一发现都非常感兴趣,希望探究其背后的意义。
ASU病毒学团队的成立是为了进行季节性流感病毒的研究,但是当2020年1月26日在亚利桑那州发现第三例COVID-19患者时,他们意识到他们拥有可以迅速地检查 SARS-CoV-2传播的所有技术和能力。Lim教授表示:“这是亚利桑那州立大学一生难得的科学机会,能够为了解这种病毒在我们社区中的传播方式做贡献。作为一个团队,我们可以发挥重要作用。”
SARS-CoV-2产生辅助蛋白,以帮助其感染人类宿主、复制并最终在人与人之间传播。基因组删除从新冠病毒辅助蛋白ORF7a中删除了27个氨基酸。该蛋白与2003年SARS病毒相关的ORF7a/X4非常相似。
ASU小组现在正在努力开展进一步的实验,以了解病毒突变的功能后果。病毒蛋白被认为可以帮助SARS-CoV-2逃避人类防御,最终杀死细胞。这可以释放病毒,使其以连锁反应的形式感染其它细胞,从而迅速导致病毒在整个体内复制自身,最终在初次感染后8-14天引起严重的COVID-19症状。
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参考资料:
(1)Scientific team finds new, unique mutation in coronavirus study
(2)An 81 base-pair deletion in SARS-CoV-2 ORF7a identified from sentinel surveillance in Arizona (Jan-Mar 2020)
(2)其它公开资料。版权归拥有者。
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