新冠病毒的核酸检测——科维思数字PCR将提供更全面的解决方案

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新冠病毒的核酸检测——科维思数字PCR将提供更全面的解决方案
中国医学科学院院长王辰院士在接受央视采访时表示,新型冠状病毒感染的核酸检测只有30~50%的阳性率。这就意味着,有不少的“假阴性”病人不能得到及时的医学隔离和救治。
针对新型冠状病毒核酸检测试剂频繁出现“假阴性”的现象,2020年2月28日,药时代特别邀请南京科维思董事长兼CSO王焱博士莅临网络直播间,为朋友们深入解读“新冠病毒的核酸检测”。

新冠病毒的核酸检测——科维思数字PCR将提供更全面的解决方案

王焱博士首先从冠状病毒的由来谈起,讲解了病毒的种类、蛋白结构基础信息,随后谈到目前国内核酸检测新冠病毒的产品注册、审批状态及产品性能分析。

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有报道提出“数字PCR的灵敏度比荧光定量PCR高1-2个数量级”。王焱博士表达了她对于核酸检测各环节的理解以及数字PCR对于新冠病毒核酸检测到底能够提供哪些助力?

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通过两个技术平台一系列的比较我们可以获悉,荧光定量PCR方法依赖于标准曲线或参照基因来测定核酸量,往往会有诸多限制因素,比如抑制剂、扩增效率等限制。而数字PCR对于新冠病毒检测的核心优势是:
•检测准确性高、灵敏度高,整体操作简单,系统稳定,重复性优良。
•芯片式数字PCR 可以有效避免样本间交叉污染。
新冠病毒是RNA病毒,本身稳定性较低,但传染性极高。在临床检测中,患者采样、样品保存运输、核酸提取纯化到最终出具检测,这是一个连贯的受控过程,中间任何一个环节出现问题,都会影响到检测结果的准确性。
新冠病毒的核酸检测——科维思数字PCR将提供更全面的解决方案
(检验流程图)
王焱博士认为:在整个样本检测的流程中,上游样本的处理尤为关键
  • 在样本采集及保存阶段,选取了国内4家企业的产品,从保存体积、产品描述等维度发表自己的看法。王博士提出了两个建议:一是采样规范很重要,需要采集足够的样本。另一个是样本采集后尽可能多提高起始量。这也是潜在且比较容易提高检测灵敏度的解决方法。
  • 在核酸纯化阶段,选取了国内5家企业的产品,从样本起始量、洗脱体积等方面进行了探讨。王博士建议大家可以尝试:如有提取体积上限的时候可以试着多次处理累计样本,对于疑似或者高度怀疑的样本,可以尝试采取这样的方式。对于洗脱的体积,尽可能多增加纯化后样本量。这同样也是提高检测灵敏度的机会。
  • 在核酸检测阶段,选取了国内4家企业的产品,从核酸上样量、检测限等角度进行了分享。王博士认为:如果上游洗脱体积小,上游纯化的洗脱体积尽可能少,增加样本浓度,这是一个很重要的事情。大家有提到,如果纯化洗脱体系小,会有抑制剂抑制PCR的反应。数字PCR因为在微孔进行反应,所以被抑制的概率会更低,可以比较好地应对这个问题。其中的平衡需要大家去摸索和积累。

随后,王焱博士介绍了美国CDC相关的内容并分享了个人对于数字PCR检验产品开发的经验美国CDC整个流程非常规范和严谨,会很明确地规定所有的操作步骤和检测流程。如检测采样需要同时取得上、下呼吸道的样本,这样采样才全面。同时也会告诉大家什么样的动作是错的,什么样的动作是对的,以及各种情况的应对方案。科维思也是遵循该体系进行的产品开发。

美国CDC对于新冠病毒的检测目前只要求检测N gene,科维思芯片式数字PCR试剂根据中国的检测指导原则,可以同时检测N gene 和ORF1ab gene两个基因。

随后,王焱博士和观看直播的观众进行了线上互动。探讨了如:平台技术方面中美检测差异有多大?数字PCR新冠检测的应用场景是什么?检测试剂的内参是什么?这次疫情会加快检测技术的发展吗?等,就大家关注的问题进行了精彩的互动解答。
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回看直播视频。

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关于王焱博士
王焱博士,南京科维思董事长兼CEO。王琰博士具有丰富的高通量测序技术及数字PCR设备、试剂产品研发及注册经验,熟悉临床检验需求。王博士曾在美国Peptimmune生物技术公司任职项目经理,从事高通量测序相关的技术和产品开发;后加入美国Helicos生物科技公司从事高通量测序文库构建流程和技术开发;曾在美国EPICENTRE生物技术公司任专业应用领域专家,主要从事高通量测序试剂新产品的开发以及行业应用工作;2012年创办南京科维思,现任股份公司董事长、首席科学家。王焱博士主导的数字PCR平台取得了国内首张三类检测试剂注册证——“HER2基因扩增检测试剂盒”(数字PCR法)。

王博士本科就读于北京大学生物系,在美国纽约州立大学锡拉丘茨分校获得细胞生物学硕士,后在美国哥伦比亚大学获得博士学位,曾在加州理工大学从事博士后研究。

关于科维思

南京科维思是一家专注于基因检测的仪器及试剂研发、生产、注册、销售企业,在南京拥有万级和十万级的GMP厂房及经过美国CLIA认证的临床检测实验室,在美国加州圣地亚哥设有技术开发和海外市场中心。主要客户类型包括:医院临床诊断科室、医药及生物公司、第三方独立医学检验所及科研政府机构。公司提供数字PCR和NGS相关的设备、耗材、试剂及临床检验的整体解决方案。目前数字PCR的平台现拥有肿瘤和传染病两条业务:肿瘤平台包括国内首款HER2基因扩增检测三类试剂盒(数字PCR法)及其余10个基因共计59个不同突变的检测产品;传染病平台现推出新型冠状病毒检测试剂盒(数字PCR法)。

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