韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

原文始发于微信公众号(药时代):韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组
韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

作者:椰子

来源:iNature

药时代获得授权转载,衷心感谢!

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组
2016年5月3日,韩春雨团队在Nature Biotechnology在线发表题为“DNA-guided genome editing using the Natronobacterium gregoryi Argonaute”的研究论文,该研究发现Natronobacterium gregoryi Argonaute(NgAgo)是一种DNA引导的核酸内切酶,适用于人类细胞的基因组编辑,这一下子使NgAgo火遍全球,广大研究人员去验证其效果,很不幸,没有相关的团队能确定NgAgo有基因编辑的功能。随后引发广泛质疑,2017年8月3日,韩春雨撤回该论文。2018年8月31日,河北科技大学取消了韩春雨所获得的荣誉称号,终止了韩春雨团队承担的科研项目并收回了科研经费,收回了韩春雨团队所获校科研绩效奖励。

不过,其他团队有另外的发现,南通大学刘东团队在Cell Research发表题为“NgAgo-based fabp11a gene knockdown causes eye developmental defects in zebrafish”的研究论文,该研究发现gDNA / NgAgo可以与靶基因结合以阻断其转录,同时该研究也没有发现NgAgo具有基因编辑的能力。

在2020年12月23日,Kevin Solomon团队在bioRxiv平台在线发表了题为“NgAgo DNA endonuclease activity enhances homologous recombination in E. coli”的研究论文,该研究发现NgAgo在非嗜盐宿主中表达较差,即使重新折叠后,大多数蛋白质仍不溶且无活性。但是,可溶部分确实起着DNA核酸内切酶的作用。结构同源性建模显示,NgAgo与其他具有催化活性的pAgo共享规范结构域,但还包含以前无法识别的单链DNA结合结构域(repA)。repA和PIWI结构域都参与NgAgo的DNA裂解活性。该研究还显示,NgAgo在体外和大肠杆菌中裂解特定的DNA。该研究还发现,这些核酸内切酶活性对于在大肠杆菌中增强的NgAgo指导的同源重组是必不可少的。

另外,在2019年1月30日,华中农业大学张安定,金梅林,韩丽及同济大学项耀祖共同通讯在Nucleic Acids Research在线发表题为“The prokaryotic Argonaute proteins enhance homology sequence-directed recombination in bacteria”的研究论文,该研究发现Nagonobacterium gregoryi Argonaute(NgAgo)以80-100%的效率增强巴斯德氏菌和大肠杆菌中的基因插入或缺失, 有趣的是,在其他pAgos蛋白中也观察到这种效应,包括Thermus thermophilus Argonaute(TtAgo),Aquifex aeolicus Argonaute(AaAgo)和Pyrococcus furiosus Argonaute(PfAgo)。NgAgo作为一种独立于其潜在酶活性的有效阳性选择系统,主要通过其与重组酶A(recA)相互作用的PIWI样结构域来增强recA介导的DNA链交换。 该研究揭示了一种用于增强细菌中同源序列指导基因编辑的新系统。

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组
韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

最初在真核生物中发现Argonaute蛋白(Agos)作为RNA干扰系统中的关键蛋白。真核Agos和原核Agos(pAgos)主要有2个部分组成,其中一个叶由氨基末端(N)和PIWI-Argonaute-Zwille(PAZ)结构域组成,而另一个由中间组成( MID)和PIWI构成。MID和PAZ结构域通常形成结合口袋,其分别促进寡核苷酸指导的5’和3’末端的锚定。在靶标结合上,催化活性Agos的PIWI结构域(含有DEDX基序,其中X表示D,H或N(31))介导体外同源DNA靶标或RNA靶标的切割。这些表明原核生物Argonaute蛋白作为一种新型基因编辑工具的潜力。

2016年5月3日,韩春雨团队在Nature Biotechnology在线发表题为“DNA-guided genome editing using the Natronobacterium gregoryi Argonaute”的研究论文,该研究发现Natronobacterium gregoryi Argonaute(NgAgo)是一种DNA引导的核酸内切酶,适用于人类细胞的基因组编辑,这一下子使NgAgo火遍全球,广大研究人员去验证其效果,很不幸,没有相关的团队能确定NgAgo有基因编辑的功能。

随后引发广泛质疑,2017年8月3日,韩春雨撤回该论文。2018年8月31日,河北科技大学取消了韩春雨所获得的荣誉称号,终止了韩春雨团队承担的科研项目并收回了科研经费,收回了韩春雨团队所获校科研绩效奖励。

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

NgAgo在大肠杆菌等中帮助基因编辑功能

不过,其他团队有另外的发现,南通大学刘东团队在Cell Research发表题为“NgAgo-based fabp11a gene knockdown causes eye developmental defects in zebrafish”的研究论文,该研究发现gDNA / NgAgo可以与靶基因结合以阻断其转录,同时该研究也没有发现NgAgo具有基因编辑的能力。

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

NgAgo辅助基因编辑独立于其潜在的酶活性及gDNA

然而,没有研究报告NgAgo在细菌基因编辑中的潜在作用。在这里,研究人员用NgAgo和其他pAgos蛋白展示了一些细菌同基因突变体的成功遗传操作,证明了它在细菌基因编辑中的潜在作用,作为一种独立于其潜在酶活性的有效阳性选择系统。

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

NgAgo与recA相互作用并增强细菌中recA介导的DNA链交换

该研究发现Nagonobacterium gregoryi Argonaute(NgAgo)以80-100%的效率增强巴斯德氏菌和大肠杆菌中的基因插入或缺失。有趣的是,在其他pAgos蛋白中也观察到这种效应,包括Thermus thermophilus Argonaute(TtAgo),Aquifex aeolicus Argonaute(AaAgo)和Pyrococcus furiosus Argonaute(PfAgo)。

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

NgAgo的PIWI样结构域是促进细菌基因编辑所必需的

NgAgo作为一种独立于其潜在酶活性的有效阳性选择系统主要通过其与重组酶A(recA)相互作用的PIWI样结构域来增强recA介导的DNA链交换。该研究揭示了一种用于增强细菌中同源序列指导基因编辑的新系统。

另外,在2020年12月23日,Kevin Solomon团队在bioRxiv平台在线发表了题为“NgAgo DNA endonuclease activity enhances homologous recombination in E. coli”的研究论文,该研究发现NgAgo在非嗜盐宿主中表达较差,即使重新折叠后,大多数蛋白质仍不溶且无活性。但是,可溶部分确实起着DNA核酸内切酶的作用

结构同源性建模显示,NgAgo与其他具有催化活性的pAgo共享规范结构域,但还包含以前无法识别的单链DNA结合结构域(repA)。repA和PIWI结构域都参与NgAgo的DNA裂解活性。该研究还显示,NgAgo在体外和大肠杆菌中裂解特定的DNA。该研究还发现,这些核酸内切酶活性对于在大肠杆菌中增强的NgAgo指导的同源重组是必不可少的。

参考信息:
  • https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz040/5304309

  • https://www.biorxiv.org/content/10.1101/597237v2

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组
END
版权声明/免责声明
本文为授权转载作品,仅供感兴趣的个人谨慎参考,非商用,非医用、非投资用。
版权归拥有者。衷心感谢!
文中图片取自网络,根据CC0协议使用,版权归拥有者。
任何问题,请与我们联系。衷心感谢!
韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

推荐阅读

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组点击这里,欣赏更多精彩内容!

发布者:药时代,转载请首先联系contact@drugtimes.cn获得授权

分享本页
返回顶部
韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组 | 药时代

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

原文始发于微信公众号(药时代):韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组
韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

作者:椰子

来源:iNature

药时代获得授权转载,衷心感谢!

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组
2016年5月3日,韩春雨团队在Nature Biotechnology在线发表题为“DNA-guided genome editing using the Natronobacterium gregoryi Argonaute”的研究论文,该研究发现Natronobacterium gregoryi Argonaute(NgAgo)是一种DNA引导的核酸内切酶,适用于人类细胞的基因组编辑,这一下子使NgAgo火遍全球,广大研究人员去验证其效果,很不幸,没有相关的团队能确定NgAgo有基因编辑的功能。随后引发广泛质疑,2017年8月3日,韩春雨撤回该论文。2018年8月31日,河北科技大学取消了韩春雨所获得的荣誉称号,终止了韩春雨团队承担的科研项目并收回了科研经费,收回了韩春雨团队所获校科研绩效奖励。

不过,其他团队有另外的发现,南通大学刘东团队在Cell Research发表题为“NgAgo-based fabp11a gene knockdown causes eye developmental defects in zebrafish”的研究论文,该研究发现gDNA / NgAgo可以与靶基因结合以阻断其转录,同时该研究也没有发现NgAgo具有基因编辑的能力。

在2020年12月23日,Kevin Solomon团队在bioRxiv平台在线发表了题为“NgAgo DNA endonuclease activity enhances homologous recombination in E. coli”的研究论文,该研究发现NgAgo在非嗜盐宿主中表达较差,即使重新折叠后,大多数蛋白质仍不溶且无活性。但是,可溶部分确实起着DNA核酸内切酶的作用。结构同源性建模显示,NgAgo与其他具有催化活性的pAgo共享规范结构域,但还包含以前无法识别的单链DNA结合结构域(repA)。repA和PIWI结构域都参与NgAgo的DNA裂解活性。该研究还显示,NgAgo在体外和大肠杆菌中裂解特定的DNA。该研究还发现,这些核酸内切酶活性对于在大肠杆菌中增强的NgAgo指导的同源重组是必不可少的。

另外,在2019年1月30日,华中农业大学张安定,金梅林,韩丽及同济大学项耀祖共同通讯在Nucleic Acids Research在线发表题为“The prokaryotic Argonaute proteins enhance homology sequence-directed recombination in bacteria”的研究论文,该研究发现Nagonobacterium gregoryi Argonaute(NgAgo)以80-100%的效率增强巴斯德氏菌和大肠杆菌中的基因插入或缺失, 有趣的是,在其他pAgos蛋白中也观察到这种效应,包括Thermus thermophilus Argonaute(TtAgo),Aquifex aeolicus Argonaute(AaAgo)和Pyrococcus furiosus Argonaute(PfAgo)。NgAgo作为一种独立于其潜在酶活性的有效阳性选择系统,主要通过其与重组酶A(recA)相互作用的PIWI样结构域来增强recA介导的DNA链交换。 该研究揭示了一种用于增强细菌中同源序列指导基因编辑的新系统。

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组
韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

最初在真核生物中发现Argonaute蛋白(Agos)作为RNA干扰系统中的关键蛋白。真核Agos和原核Agos(pAgos)主要有2个部分组成,其中一个叶由氨基末端(N)和PIWI-Argonaute-Zwille(PAZ)结构域组成,而另一个由中间组成( MID)和PIWI构成。MID和PAZ结构域通常形成结合口袋,其分别促进寡核苷酸指导的5’和3’末端的锚定。在靶标结合上,催化活性Agos的PIWI结构域(含有DEDX基序,其中X表示D,H或N(31))介导体外同源DNA靶标或RNA靶标的切割。这些表明原核生物Argonaute蛋白作为一种新型基因编辑工具的潜力。

2016年5月3日,韩春雨团队在Nature Biotechnology在线发表题为“DNA-guided genome editing using the Natronobacterium gregoryi Argonaute”的研究论文,该研究发现Natronobacterium gregoryi Argonaute(NgAgo)是一种DNA引导的核酸内切酶,适用于人类细胞的基因组编辑,这一下子使NgAgo火遍全球,广大研究人员去验证其效果,很不幸,没有相关的团队能确定NgAgo有基因编辑的功能。

随后引发广泛质疑,2017年8月3日,韩春雨撤回该论文。2018年8月31日,河北科技大学取消了韩春雨所获得的荣誉称号,终止了韩春雨团队承担的科研项目并收回了科研经费,收回了韩春雨团队所获校科研绩效奖励。

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

NgAgo在大肠杆菌等中帮助基因编辑功能

不过,其他团队有另外的发现,南通大学刘东团队在Cell Research发表题为“NgAgo-based fabp11a gene knockdown causes eye developmental defects in zebrafish”的研究论文,该研究发现gDNA / NgAgo可以与靶基因结合以阻断其转录,同时该研究也没有发现NgAgo具有基因编辑的能力。

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

NgAgo辅助基因编辑独立于其潜在的酶活性及gDNA

然而,没有研究报告NgAgo在细菌基因编辑中的潜在作用。在这里,研究人员用NgAgo和其他pAgos蛋白展示了一些细菌同基因突变体的成功遗传操作,证明了它在细菌基因编辑中的潜在作用,作为一种独立于其潜在酶活性的有效阳性选择系统。

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

NgAgo与recA相互作用并增强细菌中recA介导的DNA链交换

该研究发现Nagonobacterium gregoryi Argonaute(NgAgo)以80-100%的效率增强巴斯德氏菌和大肠杆菌中的基因插入或缺失。有趣的是,在其他pAgos蛋白中也观察到这种效应,包括Thermus thermophilus Argonaute(TtAgo),Aquifex aeolicus Argonaute(AaAgo)和Pyrococcus furiosus Argonaute(PfAgo)。

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

NgAgo的PIWI样结构域是促进细菌基因编辑所必需的

NgAgo作为一种独立于其潜在酶活性的有效阳性选择系统主要通过其与重组酶A(recA)相互作用的PIWI样结构域来增强recA介导的DNA链交换。该研究揭示了一种用于增强细菌中同源序列指导基因编辑的新系统。

另外,在2020年12月23日,Kevin Solomon团队在bioRxiv平台在线发表了题为“NgAgo DNA endonuclease activity enhances homologous recombination in E. coli”的研究论文,该研究发现NgAgo在非嗜盐宿主中表达较差,即使重新折叠后,大多数蛋白质仍不溶且无活性。但是,可溶部分确实起着DNA核酸内切酶的作用

结构同源性建模显示,NgAgo与其他具有催化活性的pAgo共享规范结构域,但还包含以前无法识别的单链DNA结合结构域(repA)。repA和PIWI结构域都参与NgAgo的DNA裂解活性。该研究还显示,NgAgo在体外和大肠杆菌中裂解特定的DNA。该研究还发现,这些核酸内切酶活性对于在大肠杆菌中增强的NgAgo指导的同源重组是必不可少的。

参考信息:
  • https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz040/5304309

  • https://www.biorxiv.org/content/10.1101/597237v2

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组
END
版权声明/免责声明
本文为授权转载作品,仅供感兴趣的个人谨慎参考,非商用,非医用、非投资用。
版权归拥有者。衷心感谢!
文中图片取自网络,根据CC0协议使用,版权归拥有者。
任何问题,请与我们联系。衷心感谢!
韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

推荐阅读

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组

韩春雨发表的NgAgo又有新功能,2文章连发,华中农业大学张安定等揭示NgAgo增加同源重组点击这里,欣赏更多精彩内容!

发布者:药时代,转载请首先联系contact@drugtimes.cn获得授权

分享本页
返回顶部